Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ21

PHACTR4, Phosphatase and actin regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR4Q8IZ21 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PHACTR4Q8IZ21 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms