Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SMYD4Q8IYR2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMYD4Q8IYR2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms