Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NELFCDQ8IXH7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.4 ms