Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW6

ARID3B, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3BQ8IVW6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3BQ8IVW6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARID3BQ8IVW6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms