Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNMB4Q86W47 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms