Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B1

NEGR1, Neuronal growth regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEGR1Q7Z3B1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEGR1Q7Z3B1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEGR1Q7Z3B1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms