Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BEND4Q6ZU67 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BEND4Q6ZU67 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms