Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RBM43Q6ZSC3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RBM43Q6ZSC3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms