Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf47Q6ZRZ4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms