Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM136Q6ZRR5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM136Q6ZRR5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms