Protein–RNA interactions for Protein: Q6VN20

RANBP10, Ran-binding protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP10Q6VN20 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANBP10Q6VN20 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
RANBP10Q6VN20 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RANBP10Q6VN20 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RANBP10Q6VN20 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RANBP10Q6VN20 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RANBP10Q6VN20 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RANBP10Q6VN20 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RANBP10Q6VN20 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RANBP10Q6VN20 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RANBP10Q6VN20 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RANBP10Q6VN20 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RANBP10Q6VN20 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RANBP10Q6VN20 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RANBP10Q6VN20 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RANBP10Q6VN20 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RANBP10Q6VN20 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RANBP10Q6VN20 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RANBP10Q6VN20 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RANBP10Q6VN20 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RANBP10Q6VN20 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RANBP10Q6VN20 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RANBP10Q6VN20 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RANBP10Q6VN20 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RANBP10Q6VN20 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RANBP10Q6VN20 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RANBP10Q6VN20 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms