Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINGO4Q6UY18 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINGO4Q6UY18 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms