Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXT8

ALKAL1, ALK and LTK ligand 1, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL1Q6UXT8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ALKAL1Q6UXT8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALKAL1Q6UXT8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms