Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CASC1Q6TDU7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASC1Q6TDU7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms