Protein–RNA interactions for Protein: Q6P995

FAM171B, Protein FAM171B, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM171BQ6P995 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM171BQ6P995 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM171BQ6P995 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM171BQ6P995 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM171BQ6P995 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM171BQ6P995 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM171BQ6P995 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM171BQ6P995 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM171BQ6P995 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM171BQ6P995 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM171BQ6P995 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM171BQ6P995 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM171BQ6P995 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM171BQ6P995 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM171BQ6P995 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM171BQ6P995 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM171BQ6P995 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms