Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKN3Q6P5Z2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms