Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TYW3Q6IPR3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TYW3Q6IPR3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TYW3Q6IPR3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TYW3Q6IPR3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TYW3Q6IPR3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TYW3Q6IPR3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TYW3Q6IPR3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TYW3Q6IPR3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TYW3Q6IPR3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TYW3Q6IPR3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TYW3Q6IPR3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TYW3Q6IPR3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TYW3Q6IPR3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TYW3Q6IPR3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TYW3Q6IPR3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TYW3Q6IPR3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TYW3Q6IPR3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TYW3Q6IPR3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TYW3Q6IPR3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TYW3Q6IPR3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TYW3Q6IPR3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYW3Q6IPR3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYW3Q6IPR3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYW3Q6IPR3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYW3Q6IPR3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYW3Q6IPR3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYW3Q6IPR3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYW3Q6IPR3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYW3Q6IPR3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYW3Q6IPR3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TYW3Q6IPR3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TYW3Q6IPR3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TYW3Q6IPR3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TYW3Q6IPR3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TYW3Q6IPR3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TYW3Q6IPR3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TYW3Q6IPR3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TYW3Q6IPR3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms