Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG16L1Q676U5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms