Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM78Q5T7P6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM78Q5T7P6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM78Q5T7P6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM78Q5T7P6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM78Q5T7P6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM78Q5T7P6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM78Q5T7P6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM78Q5T7P6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM78Q5T7P6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM78Q5T7P6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM78Q5T7P6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM78Q5T7P6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM78Q5T7P6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM78Q5T7P6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM78Q5T7P6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM78Q5T7P6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM78Q5T7P6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM78Q5T7P6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM78Q5T7P6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM78Q5T7P6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM78Q5T7P6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM78Q5T7P6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM78Q5T7P6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM78Q5T7P6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM78Q5T7P6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM78Q5T7P6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM78Q5T7P6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM78Q5T7P6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM78Q5T7P6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms