Protein–RNA interactions for Protein: Q5T655

CFAP58, Cilia- and flagella-associated protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP58Q5T655 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP58Q5T655 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms