Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZK1Q5T2W1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms