Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms