Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSL3PQ5NE16 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms