Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XKR4Q5GH76 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms