Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC178Q5BJE1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms