Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TDRD12Q587J7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TDRD12Q587J7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TDRD12Q587J7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TDRD12Q587J7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRD12Q587J7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRD12Q587J7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRD12Q587J7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRD12Q587J7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRD12Q587J7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms