Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COBLL1Q53SF7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms