Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGAP29Q52LW3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms