Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf46Q504U0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf46Q504U0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf46Q504U0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf46Q504U0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C4orf46Q504U0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C4orf46Q504U0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C4orf46Q504U0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C4orf46Q504U0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C4orf46Q504U0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C4orf46Q504U0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4orf46Q504U0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms