Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KHDC1Q4VXA5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KHDC1Q4VXA5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms