Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC36A3Q495N2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC36A3Q495N2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms