Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms