Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms