Protein–RNA interactions for Protein: Q38SD2

LRRK1, Leucine-rich repeat serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRK1Q38SD2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRK1Q38SD2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 379.4 ms