Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms