Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDO1Q16878 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
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