Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKN1Q16512 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
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