Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF56Q15929 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF56Q15929 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF56Q15929 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF56Q15929 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF56Q15929 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF56Q15929 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF56Q15929 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF56Q15929 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF56Q15929 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF56Q15929 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF56Q15929 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF56Q15929 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF56Q15929 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF56Q15929 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF56Q15929 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF56Q15929 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF56Q15929 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF56Q15929 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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