Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIX1Q15475 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
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