Protein–RNA interactions for Protein: Q15293

RCN1, Reticulocalbin-1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN1Q15293 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCN1Q15293 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCN1Q15293 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCN1Q15293 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCN1Q15293 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCN1Q15293 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCN1Q15293 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCN1Q15293 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCN1Q15293 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCN1Q15293 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCN1Q15293 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCN1Q15293 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCN1Q15293 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCN1Q15293 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCN1Q15293 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCN1Q15293 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCN1Q15293 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCN1Q15293 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCN1Q15293 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RCN1Q15293 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCN1Q15293 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCN1Q15293 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCN1Q15293 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCN1Q15293 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCN1Q15293 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCN1Q15293 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCN1Q15293 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCN1Q15293 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCN1Q15293 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RCN1Q15293 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms