Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM25Q14258 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM25Q14258 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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