Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms