Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1CQ13936 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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