Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms