Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FHL3Q13643 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FHL3Q13643 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FHL3Q13643 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FHL3Q13643 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FHL3Q13643 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FHL3Q13643 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FHL3Q13643 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FHL3Q13643 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FHL3Q13643 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FHL3Q13643 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FHL3Q13643 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FHL3Q13643 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FHL3Q13643 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FHL3Q13643 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FHL3Q13643 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FHL3Q13643 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FHL3Q13643 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FHL3Q13643 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FHL3Q13643 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FHL3Q13643 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FHL3Q13643 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FHL3Q13643 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FHL3Q13643 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FHL3Q13643 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FHL3Q13643 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FHL3Q13643 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FHL3Q13643 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FHL3Q13643 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FHL3Q13643 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FHL3Q13643 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms