Protein–RNA interactions for Protein: Q13641

TPBG, Trophoblast glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGQ13641 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPBGQ13641 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243.6 ms