Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms