Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERCC8Q13216 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERCC8Q13216 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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