Protein–RNA interactions for Protein: Q13070

GAGE6, G antigen 6, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAGE6Q13070 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GAGE6Q13070 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GAGE6Q13070 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAGE6Q13070 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GAGE6Q13070 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GAGE6Q13070 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GAGE6Q13070 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GAGE6Q13070 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GAGE6Q13070 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GAGE6Q13070 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GAGE6Q13070 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms