Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFSWAPQ12872 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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